Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm28510A0A087WP28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm28510A0A087WP28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm28510A0A087WP28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28510A0A087WP28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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