Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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