Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS39Q96JC1 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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VPS39Q96JC1 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VPS39Q96JC1 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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