Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms