Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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CLIP4Q8N3C7 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CLIP4Q8N3C7 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLIP4Q8N3C7 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CLIP4Q8N3C7 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLIP4Q8N3C7 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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