Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BBS9Q3SYG4 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
BBS9Q3SYG4 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms