Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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