Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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SS18Q15532 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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SS18Q15532 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SS18Q15532 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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