Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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CHD4Q14839 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHD4Q14839 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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