Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.1 ms