Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms