Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CUL1Q13616 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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