Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SP140Q13342 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms