Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ACACAQ13085 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms