Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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USP18Q9UMW8 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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USP18Q9UMW8 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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