Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FOXQ1Q9C009 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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