Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ZNF548Q8NEK5 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ZNF548Q8NEK5 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ZNF548Q8NEK5 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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