Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SS18Q15532 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SS18Q15532 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms