Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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