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| RUNX3 | Q13761 | LST1-207 | ENST00000376092 | 285 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356967.1-201 | ENST00000406305 | 431 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | PCNPP4-201 | ENST00000414817 | 517 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | POF1B-201 | ENST00000262753 | 3941 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ROS1-201 | ENST00000368507 | 7417 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VWC2L-202 | ENST00000427124 | 4480 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | USP28-213 | ENST00000544967 | 3498 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCEANC-201 | ENST00000380600 | 2988 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF678-201 | ENST00000343776 | 8556 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SERPINA7-202 | ENST00000372563 | 1600 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POLK-210 | ENST00000508526 | 2019 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CTAGE5-207 | ENST00000396165 | 3071 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTO1-212 | ENST00000498286 | 10857 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CSMD1-215 | ENST00000537824 | 13512 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RASGRP1-209 | ENST00000559830 | 1910 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF418-205 | ENST00000595830 | 3543 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FLG2-201 | ENST00000388718 | 9124 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360014.1-201 | ENST00000562922 | 2084 nt | TSL 3 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SNORA70.2-201 | ENST00000364506 | 135 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | OR6C1-201 | ENST00000379668 | 1064 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | QRSL1P2-201 | ENST00000418582 | 964 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | UBE2V2P3-201 | ENST00000433562 | 437 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP11-201 | ENST00000436426 | 315 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073052.1-201 | ENST00000440417 | 714 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR7L1P-201 | ENST00000456181 | 380 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1P25-201 | ENST00000495704 | 1267 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AF117829.1-210 | ENST00000523859 | 696 nt | TSL 3 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079089.1-204 | ENST00000530194 | 572 nt | TSL 2 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124784.1-201 | ENST00000552426 | 571 nt | TSL 3 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PARP1P2-201 | ENST00000556806 | 195 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5699-201 | ENST00000578903 | 90 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA74C-1-201 | ENST00000580726 | 201 nt | BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR1S2-202 | ENST00000641683 | 941 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCDC1-203 | ENST00000406071 | 4758 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZBTB38-201 | ENST00000321464 | 3588 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDR42E1-201 | ENST00000328945 | 11566 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | TMEM68-209 | ENST00000521229 | 2400 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA1328-202 | ENST00000586135 | 1863 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TOX-201 | ENST00000361421 | 4131 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDR5B-201 | ENST00000330689 | 3720 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC91-201 | ENST00000381259 | 2334 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.94 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007382.1-201 | ENST00000624376 | 2618 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC063976.2-201 | ENST00000425667 | 3556 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139713.2-214 | ENST00000642059 | 1811 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC26A5-207 | ENST00000393729 | 2422 nt | TSL 5 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB4-243 | ENST00000637217 | 8188 nt | TSL 5 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CKS1B-201 | ENST00000308987 | 759 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF486-201 | ENST00000335117 | 3837 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FHIT-201 | ENST00000341848 | 174 nt | TSL 3 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF93-201 | ENST00000343769 | 2648 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNTN-201 | ENST00000343837 | 1090 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | APOA2-201 | ENST00000367990 | 474 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SIRPD-201 | ENST00000381621 | 823 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR129-1-201 | ENST00000384972 | 72 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EHBP1-202 | ENST00000405015 | 4108 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01198-201 | ENST00000416521 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATG4AP1-201 | ENST00000416893 | 538 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00993-201 | ENST00000420453 | 540 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7AP61-201 | ENST00000443410 | 636 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01768-201 | ENST00000453347 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL10P17-201 | ENST00000453852 | 316 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FO393401.1-201 | ENST00000453914 | 600 nt | TSL 3 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ENPP7P11-201 | ENST00000505915 | 627 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091868.1-201 | ENST00000508746 | 304 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02236-201 | ENST00000508881 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.719-201 | ENST00000517156 | 106 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND2P7-201 | ENST00000521337 | 640 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079089.1-202 | ENST00000528800 | 1256 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FPGT-208 | ENST00000534056 | 1426 nt | TSL 2 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006206.2-202 | ENST00000537714 | 648 nt | TSL 5 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244502.1-203 | ENST00000541008 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC089984.1-201 | ENST00000552780 | 1431 nt | TSL 3 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC116553.2-201 | ENST00000564203 | 463 nt | BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02137-203 | ENST00000567448 | 930 nt | TSL 5 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591926.2-202 | ENST00000615199 | 719 nt | TSL 5 BASIC | 4.93 | □□□□□ -1.62 | | |