Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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