Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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PTCH1Q13635 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTCH1Q13635 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
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