Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms