Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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