Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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