Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms