Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms