Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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RFXAPO00287 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RFXAPO00287 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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