Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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