Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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