Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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