Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNFT2Q96EX2 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms