Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms