Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TMIEQ8NEW7 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms