Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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NDUFA9Q16795 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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NDUFA9Q16795 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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NDUFA9Q16795 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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NDUFA9Q16795 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NDUFA9Q16795 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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