Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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