Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PDK4Q16654 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms