Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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