Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CHD4Q14839 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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