Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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CNGB1Q14028 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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CNGB1Q14028 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CNGB1Q14028 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
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CNGB1Q14028 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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