Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms