Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HTR4Q13639 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HTR4Q13639 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HTR4Q13639 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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