Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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