Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SP140Q13342 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SP140Q13342 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SP140Q13342 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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SP140Q13342 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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SP140Q13342 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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