Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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MKRN3Q13064 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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