Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms