Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms