Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD10P28358 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms