Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms