Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms