Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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TMIEQ8NEW7 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TMIEQ8NEW7 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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